Afin d’organiser le fruit de son travail de recherche, ACS offre à chaque utilisateur la possibilité de créer des dossiers dans lesquels il va classer les requêtes et les ressources sauvegardées. A la façon de répertoires sur un ordinateur, chaque dossier va permettre de regrouper plusieurs requêtes ainsi que l’ensemble des ressources clés pour une thématique donnée, pour un projet ou pour un simple travail de recherche documentaire.
De la même façon que pour les requêtes et les ressources, chaque dossier sera décrit par l’utilisateur par un ensemble de métadonnées (nom, description, mots clés) qui lui permettront de mieux organiser puis partager l’information.
Les tags, ou « étiquettes » sont des mots clés qui peuvent être associés aux différents objets de ACS afin de les annoter, de les décrire, de les trier, de les organiser. Ainsi, ACS permet à chaque utilisateur d’associer des tags aux requêtes, aux ressources ou aux alertes qu’il enregistre, aux dossiers qu’il gère, mais aussi aux autres utilisateurs.
Ce système d’annotation offre à la fois des fonctions avancées d’annotation contrôlée et de « folksonomie » à la façon du Web 2.0. Il permet d’enrichir les données du système d’information sans modifier les applications et serveurs existants, tout en permettant à chaque utilisateur ou communauté d’intérêt de requalifier une donnée par rapport à un objectif métier propre.